輪狀病毒（RV）在生產(chǎn)系統(tǒng)中很常見，很容易污染分娩和育兒系統(tǒng)，而新的菌株可能會(huì)導(dǎo)致臨床問題。與大多數(shù)RNA病毒一樣，它通常對許多消毒劑具有抗性，康復(fù)的豬通常仍是無癥狀的攜帶者。

Burrough解釋說，輪狀病毒被分為10個(gè)基因組（A到J），其中A到C在美國豬中普遍檢測到。每個(gè)基因型都有許多血清型。

Burrough說：“輪狀病毒組之間或組內(nèi)幾乎沒有交叉保護(hù)，而且有許多基因型和血清型。在斷奶豬中出現(xiàn)單一病毒病例是不常見的。隨著時(shí)間的推移，豬經(jīng)常排放多種輪狀病毒。”

Burrough說，診斷應(yīng)該通過臨床癥狀和組織學(xué)，以及特定的實(shí)驗(yàn)室檢測，包括對A、B和C組的聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）。他補(bǔ)充說，當(dāng)存在多種輪狀病毒時(shí)，直接檢測分析（免疫組化/原位雜交）是一種更好的方法，以確定哪種病毒引起了所觀察到的疾病，但這些分析并非通常適用于所有基因組，并強(qiáng)調(diào)尋找變異病毒片段的重要性。

“PCR 后測序可以確定預(yù)期的血清型，”他說。“緩解措施在與預(yù)期的田間病毒相匹配時(shí)最為有效。將檢測到的序列與商品疫苗株、自家產(chǎn)品和返飼病料的序列進(jìn)行比較，有助于確定相關(guān)性。”

Burrough說，大腸桿菌通常從提交給大學(xué)獸醫(yī)診斷實(shí)驗(yàn)室的診斷病料中分離出來，致病菌株和非致病菌株都很常見。

“致病性大腸桿菌菌株通常在血瓊脂上溶血，但單獨(dú)的溶血并不表示具有致病性。換句話說，溶血具有很高的診斷敏感性，但特異性較差，”他說。“肉眼病變是一個(gè)重要的證據(jù)。大腸桿菌定植沿小腸的長度發(fā)生在一些菌株中，但在其他菌株中可能是節(jié)段性的。”

他補(bǔ)充說：“我想通過微生物培養(yǎng)來確認(rèn)小腸內(nèi)的純培養(yǎng)菌。”致病性溶血菌株通常具有光滑或光滑/黏液菌落表型。

“基因分型提供了對潛在致病性的確認(rèn)，并且在無法用顯微鏡觀察到細(xì)菌但仍然是一個(gè)臨床問題的情況下非常有用。有了基因分型，你就不需要每一項(xiàng)證據(jù)—你只需要（對你的臨床診斷）有足夠的信心。”

Burrough說，從糞便中分離出強(qiáng)β-溶血性短螺旋體（B. hyodysenteriae, B. hampsoniiandsuanatina），傳統(tǒng)上被用來檢測豬痢疾（SD）的病原體。

豬痢疾是一種經(jīng)濟(jì)上重要的疾病，最常在生長肥育豬中觀察到，特別是在斷奶和飼料變化等應(yīng)激反應(yīng)后，它可以從母豬場垂直傳播，因?yàn)楦腥镜哪肛i往往是不明顯的帶菌者，也可水平傳播。豬痢疾疫苗在美國還沒有上市。

臨床癥狀包括帶有粘液和血液的嚴(yán)重腹瀉，當(dāng)強(qiáng)烈的β溶血性短螺旋體屬（Brachyspira spp）時(shí)，可確認(rèn)豬痢疾診斷。Burrough 解釋說，它是通過培養(yǎng)分離的，或者通過 PCR 對痢疾糞便進(jìn)行 PCR 檢測到豬痢疾的已知病因。

“曾經(jīng)是短螺旋體屬。被檢測到，確認(rèn)物種形成很重要，”他說。“培養(yǎng)提供了溶血表型；遺傳（PCR）、生化和/或基于蛋白質(zhì)的檢測的組合對于確定性鑒定很有用。”

Burroughs說，最好的做法是防止引進(jìn)，但在感染的情況下，大多數(shù)人寧愿治療而不是減群。

他說：“MIC檢測（定義為抑制可見生長的最低濃度抗生素）通常可以幫助做出治療決策。”

“使用培養(yǎng)和PCR的結(jié)合來提高診斷的敏感性和特異性。在運(yùn)輸過程中冷藏樣本，并從發(fā)病或可能有應(yīng)激的豬身上采樣。”