例如，盡管美國對兩種獲批的家禽氟喹諾酮類產品的使用施加了若干限制，但最近從20%的國內零售雞肉產品樣本中分離出了耐環丙沙星的彎曲桿菌。分子分型揭示了來自雞肉產品的耐藥空腸彎曲桿菌菌株與來自國內獲得性人類彎曲菌病病例的空腸彎曲桿菌菌株之間的關聯。1998年國家抗生素耐藥性監測系統年度報告-腸細菌（NARMS）報告，13.3%的人類彎曲桿菌分離株對環丙沙星耐藥。1999年的初步數據顯示耐藥性增加到20.5%。荷蘭、英國和西班牙也注意到耐環丙沙星彎曲桿菌與批準氟喹諾酮類藥物用于食用動物之間的時間關系。

同樣，已注意到在腸炎沙門氏菌血清型鼠傷寒沙門氏菌確定型104（DT104）中氟喹諾酮類藥物敏感性降低與英國批準和使用氟喹諾酮類藥物用于獸醫治療之間存在時間相關性。在美國，由DT104引起的人類疾病與食用未經巴氏消毒的乳制品和與家畜直接接觸有關。NARMS已經在美國發現了少量對環丙沙星敏感性降低的人類沙門氏菌分離株。雖然數量很少，但根據最低抑菌濃度等于或大于0.25mg/ml的沙門氏菌分離株的百分比測量，對環丙沙星敏感性降低的趨勢令人擔憂。沙門氏菌分離株的百分比從1996年的0.4%上升到1997年的0.6%，1998年的0.7%和1999年的1%。

NARMS還檢測從幾種動物身上分離的沙門氏菌和彎曲桿菌。分離株來自診斷實驗室、農場的健康動物以及屠宰場或加工廠收集的原料產品。對分離的沙門氏菌進行了對17種抗生素的敏感性測試，對分離的彎曲桿菌進行了對8種抗生素的耐藥性測試。1998年，沙門氏菌分離株最常見的耐藥性是四環素（占分離株的38%）、磺胺甲新唑（32%）、鏈霉素（35%）、氨芐西林（18%）、替卡西林（17%）、卡那霉素（15%）和慶大霉素（11%）。彎曲菌對四環素（60%）、萘啶酸（16%）、環丙沙星（11%）、克林霉素（7%）、阿奇霉素（6%）和紅霉素（6%）的耐藥最為常見。對多種抗生素的耐藥性是一個問題。

隨著生物體對更多抗生素產生耐藥性，治療問題變得更加復雜。1998年，40%的動物沙門氏菌分離株對2種或更多種抗生素具有耐藥性。這比1997年的25%有所增加。1998年，18%的人對5種或5種以上抗生素具有耐藥性，而1997年這一比例為11%。

不幸的是，沒有一個檢測動物病原體耐藥性的國家監測系統，因此我們無法跟蹤和報告趨勢。